Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc47Q9D024 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc47Q9D024 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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