Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms