Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2fQ9CY34 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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