Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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