Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mgme1Q9CXC3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms