Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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