Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Khdc3Q9CWU5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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