Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms