Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms