Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms