Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtprtQ99M80 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtprtQ99M80 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtprtQ99M80 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtprtQ99M80 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtprtQ99M80 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PtprtQ99M80 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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