Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms