Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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