Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apol9aQ8VDU3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms