Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Sft2d2Q8VD57 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Sft2d2Q8VD57 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Sft2d2Q8VD57 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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