Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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