Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FgbQ8K0E8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FgbQ8K0E8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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