Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms