Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm28Q8CGC6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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