Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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