Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ephb1Q8CBF3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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