Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc113Q8C5T8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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