Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms