Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms