Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClmQ7TSN2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms