Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms