Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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NipblQ6KCD5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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NipblQ6KCD5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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NipblQ6KCD5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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NipblQ6KCD5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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