Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms