Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TmpoQ61033 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TmpoQ61033 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms