Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5935Q497S0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm5935Q497S0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm5935Q497S0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm5935Q497S0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm5935Q497S0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm5935Q497S0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm5935Q497S0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm5935Q497S0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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