Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fam220aQ3ZN08 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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