Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pydc3Q3V3Q4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pydc3Q3V3Q4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pydc3Q3V3Q4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pydc3Q3V3Q4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pydc3Q3V3Q4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms