Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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