Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.1 ms