Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms