Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms