Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms