Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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