Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms