Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms