Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sh3bp2Q06649 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sh3bp2Q06649 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sh3bp2Q06649 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sh3bp2Q06649 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sh3bp2Q06649 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sh3bp2Q06649 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sh3bp2Q06649 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms