Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms