Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Taf1bP97358 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Taf1bP97358 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Taf1bP97358 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Taf1bP97358 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Taf1bP97358 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Taf1bP97358 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Taf1bP97358 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Taf1bP97358 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Taf1bP97358 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf1bP97358 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Taf1bP97358 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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