Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms