Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms