Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms