Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NodalP43021 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NodalP43021 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NodalP43021 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NodalP43021 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NodalP43021 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NodalP43021 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NodalP43021 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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NodalP43021 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NodalP43021 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NodalP43021 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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