Protein–RNA interactions for Protein: P38532

Hsf1, Heat shock factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf1P38532 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hsf1P38532 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms