Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms