Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc11P31313 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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